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- 2021 -


High Performance Microscopy and Medical Imaging: Forces, Data and Artificial Intelligence for Biomedical and Medical Research
FONDECYT 1211988, 04/2021 - 04/2025, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile PI: S Härtel (F-Med), CoI: M Concha, M Cerda, V Castañeda, H Urra, Gonzalo Perreira (HCUCH)



- 2020 -


EXZELLENZZENTRUM SANTIAGO DE CHILE-HEIDELBERG:
Center of Excellence for Innovative Research and Education
Medical Informatics
DAAD 57519605/ German Foreign Ministry, 2019 - 2024, Facultad de Medicina, CMM, DCC, U-Chile, Santiago, Chile, Chilean Project Coordinator Medical Informatics: S Härtel, German Project Coordinator Medical Informatics: H Dickhaus, Participants: A Maass (CMM, FCFM), N Hitschfeld (DCC, FCFM), P Pino (F-Med), E Tobar (HCUCH)



IA·TRAD CHILE: Inteligencia Artificial para apoyo diagnóstico y procesos de atención en radiología y tele-radiología clínica
2020-2021 ANID COVID0733: Härtel S, Cabrera G, Castañeda V, Pereira G, CIMT, HCUCH, UdeC



Multiscale mechanics and self-organizing processes in developing systems
2020-2022: ANILLO ACT192015 2020-2022: Ravasio A, Rudge T, Cerda M. Bertocchi C, Concha M.



Deep-Pathology: Plataforma de TelePatología Distribuida Basada en Blockchain y Diagnóstico Colaborativo Apoyado por Deep Learning
FONDEF IDeA I+D ID 19I10334 (2019-2021), F-Med y HCUCH U-Chile. ITMS-Chile, Tiga-Center Steinbeiss-Ger
Director: Steffen Hartel PhD, Co-Director: Eugenia Diaz PhD, Investigador: Pablo Baez PhD.



- 2019 -


Capacitaciones en Biofilm: una respuesta para superar las bacterias multi- resistentes
2019-2020 Agencia de Cooperación Chilena para el Desarrollo, Ministerio de Relaciones Exteriores, Cooperación Sur-Sur entre Chile y Uruguay.
Asociadas:Instituto Milenio de Neurociencia Biomédica (BNI) / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable.
Steffen Hartel PhD, Paola Scavone PhD, Karla Chandia, Nicole Canales




Repositorios de Información Interoperables para la Minería de Datos en la Industria de la Salud
FONDEF IDeA I+D ID19I10023 (2019-2021), Universidad Tecnica Federico Santa Maria, Universidad de Chile, Asociadas: SSVSA, CENS, INRIA, Data Image
Director: Mauricio Araya PhD, Co-Director: Mauricio Solar PhD Investigadores Marcelo Mendoza PhD, Victor Castaneda PhD.




Establishment and Exploitation of a European–Latin American Research Consortium towards Eradication of Preventable Gallbladder Cancer
Horizon2020 EU PROJECT (2020-2025)
Universitaetsklinikum Heidelberg, Hospital Puerto Montt , Universidad de la Frontera, Universidad Católica del Maule, Centre International de Recherche sur le Cáncer, Universidad De Chile, Instituto Nacional De Enfermedades Neoplásicas, Universidad Mayor De San Simón, Oslo Universitetssykehus Hf, Sanatorio El Carmen S.A. Ar, Pontificia Universidad Católica De Chile, University Of Bristol Uk, Klinikum der Johann Wolfgang Von Goethe Universität.
PI: Dr Justos Lorenzo ((U-Heidelberg), Co-I: Katherine Marcelain (U-Chile)




Unveiling how Neuronal calcium signals reach the nucleus following synapse activation
CONICYT-CHILE / BMBF-ALEMANIA 180051 (october 2019 - september 2022), Cecilia Hidalgo, Steffen Härtel, Andrea Paula-Lima, Pablo Muñoz, Tatjana Adasme, Genardo Barrientos (U-Chile) / Hilma Bading, Peter Bengtson (U-Heidelberg)



- 2018 -


Plataforma de microscopia virtual en educacion escolar StartUpChile
StartupChile Corfo 18SUP-92974 Micromundo, Inicio 2018 Junio Fin Julio 2019
PI Jorge Toledo, Felipe Santibañez, Alejandro Lavado



Desarrollo y validación industrial de un servicio de tele-análisis cuantitativo de la calidad espermática en Salmón del Atlántico.
Programa de Inserción de capital humano avanzado en el sector productivo (CONICYT 2018-2021), in CEDAI SpA, PI: E. Pulgar



Assessment of AID-related somatic signatures and their role in tumor progression of class switched vs non-switched B-cell neoplasms
FONDECYT Regular 1180882 (2018-2021), Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: Marcelo Navarrete. Co-I: Mauricio Cerda (F-Med)



Biophysical analysis of division plane selection in plant cells
FONDECYT Regular 1180906 (2018-2021), Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: Jacques Dumais. Co-I: Mauricio Cerda (F-Med)



5D Image Processing and Physical Models for the Quantification of Cell Migration and Multicellular Architecture with 4-Lens Light Sheet Fluorescence Microscopy
FONDECYT 1181823, 04/2018 - 04/2021, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: S Härtel (F-Med), CoI: M Concha, M Cerda (F-Med), V Castañeda, Néstor Sepúlveda (FCFM)



New Applications of Copper Nanoparticles from Mining Products on Emerging Technologies for Desalination Process and Energy Production
2018-2021: ACM 170003, Universidad de Chile y Universidad Tecnológica, PIs: Metropolitana, Andreina García, Humberto Estay, Natalia Hassan, Melanie Colet, Associated Investigators: Ali Akbari-Fakhrabadi, Iván Martínez, Javier Quispe, Jocelyn Dunstan, Steffen Hartel, Foreign Researcher: Paola Scavone, Leandris Argentel, Juan Rodriguez, Simeon Bebelis



Planning the implementation of data-driven computational technologies to reduce waiting lists in a health delivery network for low-income patients in Chile
2017 Healthier World Challege Grant, Johns Hopkins University, PIs: Diana Prieto, Diego Martinez, International Investigators: Jocelyn Dunstan, Rodrigo Martinez, Maria Soledad Martinez



- 2017 -


Proyecto Micromundo
Fondo de Capital Semilla para el Desarrollo Ágil de Emprendimientos TIC desde Chile para America Latina y el Mundo” Programa:FONDEF Folio/N°: 14SSAF-270 | 2017 – 2018
PIncubadora de Negocios ImagineLab Microsoft 2017 Septiembre Marzo 2018
PI Jorge Toledo, Felipe Santibañez, Claudia Reyes



Proyecto Microscopia portátil y de bajo costo impresa en 3D basada en iluminación estructurada adaptiva, una nueva alternativa de alta resolución en diagnóstico y educación. Fondo Capital Semilla Instituto Milenio de Neurociencia Biomedica
BNI abril 2017 – abril 2018. Instituto Milenio de Neurociencia Biomedica
PI Jorge Toledo, Claudia Reyes, Camillo Allende, Francisca Valdez, Felipe Santibañez.



Evaluar el uso de catéteres recubiertos con cobre en la formación de biofilms de bacterias uropatógenas
Proyecto financiado: Becas de Investigación por el Programa de Biotecnología para Latinoamérica y el Caribe de la Universidad de las Naciones Unidas (UNU‐BIOLAC). SCIAN-Lab, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile. Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable, Montevideo, Uruguay.
MSc. Victoria Iribarnegaray



Deep-Learning Based Segmentation for the Analysis of Large Biomedical Imaging
FONDECYT Iniciación 11170475, 11/2017 - 11/2020, SCIAN-Lab, CIMT, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: Dr. Victor Castañeda



CENS: Centro Nacional en Sistemas de Información en Salud
Centro de Referencia para las Tecnologías de la Información (TIs) en Salud 2017-2021, CORFO 16CTTS-66390,
Universidad de Chile, Pontificia Universidad Católica, Universidad de Valparaíso, Universidad de Talca, Universidad de Concepción
Director: Steffen Härtel (U-Chile), Co-Director: Daniel Capurro (PUC)



Diseño de un modelo de información, conceptual y semántico, para caracterizar los prestadores de salud en Chile. Condición habilitante para la interoperabilidad entre sistemas de información en salud
InnovaChile/CORFO Bien Público Estratégico de Alto Impacto para la Competitividad, 16BPE-62299, 11/2016 - 11/2018, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
Director: Steffen Härtel, Co-Director: Rodrigo Martínez



- 2016 -


Breaking the brightness constancy constraint in optical flow methods for in vivo biomedical imaging
FONDECYT Iniciación 11161033, 11/2016 - 11/2019, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: Dr. Mauricio Cerda



Role of Nodal signalling in early asymmetric brain morphogenesis of the zebrafish brain
FONDECYT 1161274, 04/2016 - 04/2019, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: Miguel Concha (F-Med), CoI: Steffen Härtel (F-Med)



CHIP: Chilean Health Info and Process Challenge
PAGEL Partnerships for the Health Sector in Developing Countries. DAAD 57220037: 2016 - 2019, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
Hochschule Heilbronn: Prof. Dr. med. Christian Fegeler, Universidad de Chile: Prof. Dr. Steffen Härtel, Universidad de la Republica: Prof. Dr. Franco Simini, MINSAL: Rodrigo Castro, Jefe Departamento Gestión Sectorial de TIC



Terminología Farmacéutica Chilena, condición habilitante para receta electrónica y otros sistemas de información en el sector salud
InnovaChile/CORFO Bienes Públicos Estratégicos 15BPE-47278, 12/2015 - 06/2017, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
Director: Steffen Härtel, Co-Director: Maurizio Mattoli



Instituto de Neurociencia Biomédica (BNI, ICM, P09-015-F)
Millennium Science Insitute, Millennium Scientific Initiative 2016-2021
Dir. Andres Couve, Dir.Sup. Claudio Hetz, PIs: Miguel Concha, Steffen Hârtel, Pedro Maldonado, Jimena Sierralta, Cecilia Hidalgo y Hernan Silva, Facultad de Medicina, U-Chile



- 2015 -


El órgano parapineal (Opp) como modulador de la actividad del núcleo habenular izquierdo (iHab): Respuesta funcional de la actividad fotosensora del Opp sobre las neuronas iHab en larva de pez cebra (Danio rerio)
FONDECYT 3160421, 11/2015 - 11/2018, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: Dra. Karina Palma. Sponsor: Steffen Hartel



Desarrollo de metodología para generación de gold-standards biomédicos para patología digital usando aprendizaje supervisado basado en múltiples expertos
FONDECYT 3160559, 11/2015 - 11/2018, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: Dra. Violeta Chang. Sponsor: Steffen Hartel



Estudio del papel de la proteina estructural nuclear especifica de la meiosis (MNS1) en la tranmission de fuerzas que generan la motilidad ciliar en pez zebra
FONDECYT 3160478, 11/2015 - 11/2018, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: Dr. Eduardo Pulgar. Sponsor: Steffen Hartel



Visualización y Manipulación de Señales y Fuerzas en Tejidos en Desarrollo
2016-2018: ANILLO ACT 1402 2015-2018: Concha M, Hartel S, Amigo J, Assar R, Cerda M



EXZELLENZZENTRUM SANTIAGO DE CHILE-HEIDELBERG:
Center of Excellence for Innovative Research and Education
Medical Informatics
DAAD 57168868 / German Foreign Ministry, 2014 - 2019, Facultad de Medicina, CMM, DCC, U-Chile, Santiago, Chile, Chilean Project Coordinator Medical Informatics: S Härtel, German Project Coordinator Medical Informatics: H Dickhaus, Participants: A Maass (CMM, FCFM), N Hitschfeld (DCC, FCFM), P Pino (F-Med), A Aguila (HCUCH)



SUBSIDIO SEMILLA DE ASIGNACION FLEXIBLE FASE 1: CORFO INNOVA
CÓDIGO PROYECTO: 14SSAF-27061 - 7: CEDAI SpA



Image Processing and Physical Models for the Interpretation of Cell Migration with 4-Lens Light Sheet Fluorescence Microscopy
FONDECYT 1151029, 04/2015 - 04/2018, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: S Härtel (F-Med), CoI: M Concha (F-Med), N Hitschfeld (DCC, FCFM), N Sepulveda (FCFM)



- 2014 -


Reproducible Research in Image and Signal Processing (ReRISiP)
Regional Program STIC-AmSud 2015-2016
Argentina, Marta Mejail, Depto. de Computación, FCEyN - UBA
Uruguay, Gregory Randall, Departamento de Procesamiento de Señales, UdelaR y Alvaro Pardo, Department of Electrical Engineering, U-Católica del Uruguay
Chile, Steffen Härtel, SCIAN-Lab, BNI, ICBM, F-Med, U-Chile
Brazil, Alejandro Frery, Universidade Federal de Alagoas
France, Jean Michel Morel, Centre de Mathématiques et de Leurs Applications, Ecole Normale Supérieure de Cachan



Unidad de Microscopia de Dinámica Celular
FONDEQUIP EQM 140156, 2014 - 2015, ICBM, Facultad de Medicina y Facultad de Odontología U-Chile
Inv. Responsable: M Estrada, Inv. Principales: C Hidalgo, E Jaimovich, AP Lima, S Härtel



Sistema de Almacenamiento y Servicios Informáticos Biomédicos Avanzados (SASIBA)
FONDEQUIP EQM140119, 2014 - 2015, ICBM, Facultad de Medicina, y Facultad de Odontología U-Chile
Inv. Responsable: S Härtel, Inv. Principales: M Concha, R Armisen, AP Lima



- 2013 -


Particle filter based tracking and segmentation pipeline for the analysis of cell shape in large biomedical imaging data
FONDECYT 3140444, 11/2013 - 11/2016, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: Dr. Victor Castañeda. Sponsor: Steffen Härtel



Structural and dynamical priors for the characterization of tubular networks in cell biology
FONDECYT 3140447, 11/2013 - 11/2016, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: Dr. Mauricio Cerda. Sponsor: Steffen Härtel



Initiative for Big-Data-Management, Processing, and Distribution
for Science and Education in R&D
Programa de Actividades Comunes FONDEF, 2013 - 2014:
D11I1096 Microscopia Virtual-Centro de Patología Digital Asisitida por Internet-
D11I1007 UPRplus una nueva terapia génica para el tratamiento de la enfermedad de Parkinson
D11I1029 Incorporación de la Secuenciación de la Última Generación en el cuidado de los pacientes con cáncer
D11I1036 Caracterización y compuestos Antigénicos Tumorales para Activación exvivo de Células Autólogas de Uso Potencial en Inmunoterapia Celular contra el Cáncer
D10I1007 Genómica de la población chilena: Obtención de perfiles genéticos necesarios en investigación clínica, salud pública y medicina forense
D11I1060 Desarrollo de una plataforma astroinformática para la administración y análisis inteligente de datos a gran escala
Coordinador Responable: S Härtel



BioMed-HPC: Red de Biología y Medicina Computacional de Alto Rendimiento
U-Redes, 2013 - 2015, Facultad de Medicina, Facultad de Odontología, U-Chile
Director: S Härtel, Co-Director: R Verdugo



- 2012 -


Light sheet based microscopy and data processing for the analysis dynamics, multicellular events in large specimen
Beca puente BNI - Postdoc, 2012 - 2013, Instituto Milenio Biomedical Neuroscience Institute (BNI) de la Iniciativa Científica Milenio (ICM, P09-015-F), U-Chile, Chile
PI: Victor Castañeda Sponsor: Steffen Härtel



Dynamics of morphology, topology, and transport processes in tubular cellular structures
Beca puente BNI - Postdoc, 2012 - 2013, Instituto Milenio Biomedical Neuroscience Institute (BNI) de la Iniciativa Científica Milenio (ICM, P09-015-F), U-Chile, Chile
PI: Mauricio Cerda Sponsor: Steffen Härtel



Papel de la adhesión diferencial y la inhibición por contacto de locomoción celular como motores de la expansión tisular en la epibolia de peces teleósteos
FONDECYT 3130598, 10/2012 - 10/2015, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: Dr. German Reig. Sponsor: Steffen Härtel



Microscopía Virtual - Centro de Patología Digital Asistida por Internet -
FONDEF D11I1096, 2012 - 2015, Facultad de Medicina, Facultad de Odontología, U-Chile, Xperts Ltda, Mattoli Ing, Santiago, Chile
Director: S Härtel, Co-Directora: E Diaz



Fast Computational Schemes for the Analysis of Morpho-Topological Data from High Throughput Microscopy
FONDECYT 1120579, 04/2012 - 04/2015, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: S Härtel (F-Med), CoI: M Concha (F-Med), N Hitschfeld (DCC, FCFM), T Asahi (CMM, FCFM)



The role of epiboly and chemokine signalling in the determination of anterior-posterior polarity in the Kupffers's vesicle of zebrafish
FONDECYT 1120558, 04/2012 - 04/2016, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: M Concha (F-Med), CoI: S Härtel (F-Med)



Red de Microscopía de Súper Resolución para Neurociencia
Proyecto Redes, Instituto Milenio Biomedical Neuroscience Institute (BNI) de la Iniciativa Científica Milenio (ICM, P09-015-F), U-Chile, Santiago, Chile
S Härtel (U-Chile), J Enderlein (U-Goettingen)



- 2011 -


Instituto de Neurociencia Biomédica (BNI, ICM, P09-015-F)
Millennium Science Insitute, Millennium Scientific Initiative 2011-2016
Steffen Härtel forma parte del BNI juntos a los investigadores Andres Couve, Claudio Hetz, Miguel Concha, Mario Herrera-Marschitz, Cecilia Hidalgo, Manuel Kukuljan, Lisette Leyton , Pedro Maldonado, Jimena Sierralta, y Hernan Silva de la Facultad de Medicina



Role of Notch signalling during neural crest migration
Medical Research Council (UK), New Investigator Research Grant G1000080 2011-2014
King's College London KCL, PI: Claudia Linker Collaborators: S Härtel, D Bensimon, L Jullien, J Lewis



- 2010 -


Structure and Dynamics of the Endoplasmic Reticulum: Molecular Mechanisms at the Interface of Form and Function
FONDECYT 3110157, 10/2010 - 10/2013, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: Dr. Omar Ramírez. Sponsor: Steffen Härtel



NEMO-SN: Scientific Network Göttingen
Biophysics & Complex System Group / NUCLEUS OF NEURAL MORPHOGENESIS
DFG, 2010 - 2011, Third Institute of Physics - Biophysics / NEMO Facultad de Medicina



- 2009 -


EXZELLENZZENTRUM SANTIAGO DE CHILE � HEIDELBERG:
Center of Excellence for Innovative Research and Education
Medical Informatics
DAAD / German Foreign Ministry, 2009 - 2014, Facultad de Medicina, CMM, DCC, U-Chile, Santiago, Chile
Chilean Coordinator: S Härtel, Participants: A Maass, N Hitschfeld, M Kukuljan, L Michea, P Pino



Espermiogramas Digitales Asistidos Por Internet (ED�AI)
FONDEF D07I1019, 02/2009 - 02/2012, Facultad de Medicina, IDIMI, U-Chile, Xperts Ltda and Clinica las Condes, Santiago, Chile
Director: S Härtel



NUCLEUS OF NEURAL MORPHOGENESIS (NEMO)
Millennium Science Nuclei, Millennium Scientific Initiative (ICM P04-068-F), 12/2009 - 12/2012, Facultad de Medicina, Santiago, Chile
M Concha, S Härtel, M Kukulian, J Sierralta, A Couve, C Hetz



Partial Differential Equations for 3D Photon Denoising, Optical Flow and Adjacent Active Surface Models for High Throughput in vivo Spinning Disk Microscopy
FONDECYT 1090246, 04/2009 - 04/2012, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: S Härtel, CoI: M Concha, N Hitschfeld, O Ramirez



Development, Evolution and Interplay of Brain Asymmetries in Teleosts
FONDECYT 1090242, 04/2009 - 04/2012, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: M Concha, CoI: S Härtel



- 2008 -


Biological Imaging Network for in vivo Analysis of Gene Function during Development
Programa Bicentenario de Ciencia y Tecnologia, 2008 - 2009, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PIs: M Concha, S Härtel, M Kukulian, J Sierralta



- 2007 -


Marlin-1 Y Receptores Inhibitorios GABAB en Sinapsis Centrales
FONDECYT 1071001, 04/2007 - 04/2010, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: A Couve, CoI: S Härtel



- 2006 -


Scaling Index Methods for the Automated Quantification of Colocalization in Fluorescence Microscopy
FONDECYT 1060890, 04/2006 - 04/2009, Facultad de Medicina, U-Chile, Santiago, Chile
PI: S Härtel, CoI: M Concha

Show Abstract 


- 2003 -


Mechanisms of Apoptotic and Necrotic Cell Death
Time Resolved Multi-Parameter Analysis of Membrane Related Processes
FONDECYT 3030065, Post-Doc, 04/2003 - 04/2006, CECS, Valdivia, Chile
PI: S Härtel, Tutor: F Barros

Show Abstract 





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