Objetivos
- Conocer proyectos de investigación, I & D, y educación vigentes que requieren el uso de HPC 2014
- Definir estrategias de colaboración y futuros proyectos entre los miembros de U-Redes BioMed-HPC
- Definir estrategias de capacitación, cursos y simposios de U-Redes BioMed-HPC
Organizadores
Steffen Härtel, PhD Director BioMedHPC, Programa de Anatomía y Biología del Desarrollo, Instituto de Neurociencias Biomédicas BNI, Instituto de Ciencias Biomédicas ICBM, Facultad de Medicina, Universidad de Chile. +56 (2) 2978-6366 shartel@med.uchile.cl www.scian.cl
Ricardo Verdugo, PhD Co- Director BioMedHPC, Programa de Genética Humana, Instituto de Ciencias Biomédicas, Facultad de Medicina, Universidad de Chile. +56 (2) 2978-9527 raverdugo@u.uchile.cl genomed.med.uchile.cl
Participantes
Chairs de Sesiones
- Sesión I Eduardo Vera / Steffen Härtel
- Sesión II Ricardo Verdugo, raverdugo@u.uchile.cl
- Sesión III Cristian Salgado, jsalgado@ing.uchile.cl
- Sesión IV Rodrigo Assar, rodrigo.assar@gmail.com
- Sesión V Steffen Härtel, shartel@med.uchile.cl
Académicos Participantes Confirmados
- Andrés Cortez GOCCHI Asistente
- Benjamin Suarez ICBM-F-Med, U-Chile Asistente
- Bettina Müller GOCCHI Asistente
- Cesar Ramirez FCQF, U-Chile Expositor
- Cristian Salgado Facultad de Ingeniería Expositor
- Eduardo Vera NLHPC, U-Chile Expositor
- Felipe Santibáñez DCC, FCFM, U-Chile Asistente
- Gerald Zapata U-Chile Asistente
- Ginés Guerrero NLHPC, U-Chile Expositor
- Gonzalo Rojas Alcayaga Facultad de Odontología Asistente
- Hugo Ju GOCCHI Asistente
- Jorge Toledo SCIAN-Lab, BNI, F-Med, U-Chile Asistente
- Jorge Mansilla SCIAN-Lab, BNI, F-Med, U-Chile Asistente
- Justo Lorenzo U-Heidelberg, Alemania Expositor
- Iván Rojas SCIAN-Lab, DCC, FCFM, U-Chile Asistente
- Luis Briones SCIAN-Lab, BNI, F-Med, U-Chile Asistente
- Luis Salinas UTFSM, Valparaiso Expositor
- Mauricio Báez FCQF, U-Chile Expositor
- Mauricio Cerda SCIAN-Lab, BNI, F-Med, U-Chile Expositor
- Nancy Hitschfeld DCC, FCFM, U-Chile Asistente
- Néstor Sepúlveda SCIAN-Lab, F-Med, U-Chile Asistente
- Oscar Peredo ALGES Lab, AMTC, FCFM, U-Chile Expositor
- Pavlos Protopapas Harvard University, EEUU Expositor
- Raquel Pezoa UTFSM, Valparaiso Expositor
- Ricardo Armisen Facultad de Medicina Expositor
- Ricardo Verdugo F-Med, U-Chile Expositor
- Rodrigo Assar F-Med, U-Chile Expositor
- Romilio Espejo Omics-solutions Asistente
- Sandra de la Fuente SCIAN-Lab, BNI, F-Med, U-Chile Asistente
- Sebastián Brauchi F-Med, USACh Expositor
- Steffen Härtel SCIAN-Lab, BNI, F-Med, U-Chile Expositor
- Tomas Pérez-Acle NLHPC, U-Chile Expositor
- Víctor Castañeda SCIAN-Lab, BNI, F-Med, U-Chile Expositor
Integrantes Externos Nacionales
- REUNA La Corporación Red Universitaria Nacional (www.reuna.cl)
- STI Dirección de Servicios de Tecnologías de la Información y Comunicaciones de la U-Chile
- GOCCHI Grupo Oncológico Cooperativo Chileno de Investigación (www.gocchi.org)
- CMM Centro de Modelamiento Matemático de la FCFM de la U-Chile (www.cmm.cl)
- OMICS El Centro Nacional de Genómica, Proteómica y Bioinformática ‘OMICS Solutions’ (www.omics-solutions.cl)
- ICBM Instituto de Ciencias Biomédicas de F-Med (www.icbm.cl)
- ESP La Escuela de Salud Pública de la F-Med reúne 53 académicos distribuidos en 4 divisiones
- CITC Centro de Investigación y Tratamiento del Cáncer, agrupa académicos de F-Med y del Hospital Clínico
- NLHPC El Laboratorio Nacional para Computación de Alto Rendimiento (www.nlhpc.cl)
- BNI El Instituto Milenio de Neurociencia Biomédica (www.bni.cl)
- FOUCH Facultad de Odontología (www.odontologia.uchile.cl) Departamento de Patología y Medicina Oral, Unidad de Biobanco
- CCTVal Centro Científico Tecnológico de Valparaíso (www.cctval.utfsm.cl)
Integrantes Externos Internacionales
- Instituto Pasteur, Montevideo, Uruguay, www.pasteur.edu.uy
- Brown University, EEUU, Providence, Rhode Island, www.brown.edu
- GIGA, Bélgica, Grappe Interdisciplinaire de Génomique Appliquée, www.giga.ulg.ac.be
Programa
Primer Encuentro Científico BioMed-HPC, Martes, 14 de Enero 2014
Sesión I: Welcome @ BioMed-HPC / Chairs – Eduardo Vera – Steffen Härtel
Steffen Härtel / Victor Castañeda]
Estado de avance del proyecto U-Redes BioMed-HPC , PDF Document PDF Document
Eduardo Vera / Ginés Guerrero
Visión y Misión: Recursos y políticas de uso del NLHPC PDF Document
Sesión II: Genómica y Bioinformática / Chair – Ricardo Verdugo
Ricardo Armisén, U-Cancer, F-Med, U-Chile
Secuenciación Genómica y Medicina Personalizada del Cáncer PDF Document
Ricardo Verdugo F-Med, U-Chile
Problemas Computacionales y Herramientas Bioinformáticas para Secuenciación Genómica en Biomedicina PDF Document
Justo Lorenzo, Universidad de Heidelberg, Alemania
HPC en el grupo Estadística Genética de la Universidad de Heidelberg PDF Document
Sesión III: Bioinformática Estructural / Chair – Cristian Salgado
Tomás Pérez-Acle, NLHPC, U-Chile
Una aproximación transdisciplinaria al estudio de la comunicación intercelular a través de Gap Junction Channels PDF Document
César Ramírez (Mauricio Báez), FCQF, U-Chile
Usando potenciales nativo-céntricos para simular el plegamiento de proteínas PDF Document
J. Cristian Salgado, FCFM, U-Chile
¿Cómo convivir con wet labs cuando tu laboratorio es un dry lab? , PDF Document PDF Document
Sesión IV: Simulación de Procesos / Chair – Rodrigo Assar
Rodrigo Assar, F-Med, U-Chile
Simulando decisiones celulares de herencia epigenética para la formación de hueso PDF Document
Oscar Peredo, ALGES Lab, AMTC, FCFM, U-Chile
HPC usage in Geo-Resources Exploration and Modeling PDF Document
Luis Salinas/ Raquel Pezoa, UTFSM, Valparaíso, Chile
HPC @ UTFSM, Valparaíso PDF Document
Sesión V: Imaging and HPC / Chair – Steffen Härtel
Sebastian Brauchi, F-Med, UACh, Valdivia, Chile
Towards Advanced Microscopy and Imaging @ UACh, Valdivia
Mauricio Cerda, SCIAN-Lab, BNI, F-Med, U-Chile
HPC for Image Processing Algorithms, Current Work and Future Perspectives PDF Document
Pavlos Protopapas, Research Scientist in Astronomy – Harvard University, EEUU
Serendipitous Discoveries in the Era of Large Astronomical Datasets PDF Document
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