Organizadores

Paola Scavone (uy) / Steffen Härtel (cl)

Modalidad

El Curso Binacional de Postgrado es un curso gratuito y consta de un total de 121 horas, de las cuales 30 horas corresponden a clases lectivas en modalidad online sincrónica/asincrónica, 60 horas de estudio de material secundario, 16 horas de formación con material asincrónico y 26 horas de prácticos y presentaciones de resultados.

Sesiones Teóricas (2-6 de octubre 2023): Las sesiones teóricas se realizarán de manera online, en modalidad sincrónica y asincrónica, durante la primera semana del curso.

Sesiones Prácticas: Se realizarán 1 semana práctica para los estudiantes uruguayos, en el IIBCE (9-13 de octubre 2023, Montevideo, Uruguay) que tendrá énfasis en el cultivo y manipulación de biofilms. La otra actividad práctica para los estudiantes chilenos se realizará en el SCIANLab, Facultad de Medicina, Universidad de Chile (30 de octubre-3 de noviembre 2023, Santiago, Chile) que tendrá énfasis en visualización de biofilms con microscopia Spinning-disk y Light-sheet, y Superresolución mediante Expansion Microscopy. Personas de otros países que quieran asistir a las sesiones prácticas dependerán de su capacidad de movilización y estadía personal. No contamos con capacidad de becas para los estudiantes.

Lugar

Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable (IIBCE), Montevideo, Uruguay (9 – 13 Oct)
Instituto de Neurociencia Biomédica (BNI), ICBM, F-Med, U-Chile, Santiago, Chile (30 Oct – 3 Nov)

Docentes

Paola Scavone (uy) / Steffen Härtel (cl) / Pablo Zunino (uy) / Jorge Jara (cl) / Eduardo de Mello (uy) / Erlen Cruz (uy) / Victor Castañeda (cl) / Claudia Etchebehere (uy) / Nicole Canales (cl) / Nicolás Navarro (uy) / Karina Palma (cl) / Luciana Robino (uy) / Dante Castagnini (cl) / Maria José González (uy) / Juan Eduardo Rodriguez (cl) / Martín Cadiz (cl)

Temáticas

Modelos para el Estudio de Biofilms
Relevancia y Características Genéticas
Nanotecnología Aplicada a Biofilms
Etapas de Formación de Biofilms
Expresión Génica y Quorum Sensing
Microscopía Aplicada a la Microbiología
Light-sheet Microscopy
Expansion Microscopy

Programa del Curso y Charlas

Programa y Calendario LINK

Lunes 2 de Octubre
SINCRONICA
Introducción al Curso y Explicación de Actividades
Clase PS Paola Scavone PDF Document Youtube
Clase Steffen Härtel PDF Document
ASINCRÓNICA
Revisión de Tutoriales y Manuales
Instalación y Configuración de Software

Martes 3 de Octubre
SINCRONICA
Clase Steffen Härtel PDF Document
Clase Claudia Etchebehere PDF document
Clase Pablo Zunino PDF Document
ASINCRÓNICA
Revisión de Tutoriales y Manuales
Instalación y Configuración de Software

Miércoles 4 de Octubre
SINCRONICA
Clase Eduardo de Mello PDF Document
Clase Jorge Jara-Wilde PDF Document
Clase Paola Scavone / María José González PDF Document
ASINCRÓNICA
Revisión de Tutoriales y Manuales
Instalación y Configuración de Software

Jueves 5 de Octubre
SINCRONICA
Clase Steffen Härtel PDF Document
Clase Luciana Robino PDF Document
Clase Práctica Nicole Canales-Huerta PDF Document
ASINCRÓNICA
Revisión de Protocolos de Formación de Biofilms
Deconvolución

Viernes 6 de Octubre
SINCRONICA
Clase Dante Castagnini PDF Document
Clase Erlen Cruz / Nicolás Navarro PDF Document
Clase Víctor Castañeda PDF Document
Clase Jorge Jara-Wilde PDF Document
ASINCRÓNICA
Revisión de Tutoriales Microscopía LINK

Manuales y Protocolos

Protocolo Dinámico PDF Document
Protocolo Estático PDF Document PDFDocument2
Huygens Professional_SVI Manual PDF Document
Actividad Practica 1 – Guía de protocolos [ingles] PDF Document
Actividad Practica 1 – Guía de trabajo grupal PDF Document
Actividad Practica 2 – Guía de trabajo grupal PDF Document
Actividad Practica 3 – Guía de protocolos PDF Document
Actividad Practica 3 – Guía de trabajo grupal PDF Document
Ejercicio Ensayo Erradicacion XLS Document
Ejercicio Ensayo Inhibicion XLS Document
Tutorial instalación Huygens PDF Documents

Protocolos Trabajo Práctico Cl

Protocolo Dinámico SCIAN PDF Document
Protocolo Estático SCIAN PDF Document
Protocolo ExM SCIAN PDF Document

Link de Interés

Global Bioimaging : https://globalbioimaging.org/
Latin American Bioimaging: https://labi.lat/es
La Red de Equipamiento Científico Avanzado: https://redeca.med.uchile.cl
Microscopy Australia: https://myscope.training
The Scale of the Universe: https://htwins.net/scale2
Photomultiplier: www.olympus-lifescience.com/en/microscope-resource
/primer/digitalimaging/concepts/photomultipliers
Chrome Spectra Viewer: www.chroma.com/spectra-viewer
Thermo Fisher Spectra: www.thermofisher.com/order/spectra-viewer

Software para Bajar e Instalar

  1. Huygens Deconvolution (SVI): https://svi.nl/tiki-login_scr.php
  2. FIJI, … is an image processing package: https://fiji.sc
  3. Icy, … an open community platform for bioimage informatics: http://icy.bioimageanalysis.org

Grupos

SESIONES ON LINE

GRUPO URUGUAY

GRUPO CHILE

Literatura

Dolan _ Costerton 2002_Biofilms Survival Mechanisms of Clinically Relevant Microorganisms PDF Document
Jonkman et al 2020_Tutorial guidance for quantitative confocal microscopy PDF Document
North 2006_Seeing is believing PDF Document
Pearson 2007_The Good The Bad and The Ugly PDF Document
Scavone et al 2016_Fimbriae have distinguishable roles in Proteus mirabilis PDF Document
Schlapp et al 2011_Development of 3D architecture of uropathogenic Proteus mirabilis batch culture PDF Document
Sweldlow et al 2021_A global view of standards for open image data formats and repositories PDF Document
Castañeda et al 2014_Computational Methods for Analysis of Dynamic Events in Cell PDF Document
Guzman Soto et al-2021_Mimicking biofilm formation PDF Document
Sauer et al 2022_The biofilm life cycle – Expanding the conceptual model of biofilm formation PDF Document
Azeredo et al 2017_Critical review on biofilm methods PDF Document
Merrit et al 2011_Growing and Analyzing Static Biofilms PDF Document

Literatura Clase Eduardo de Mello
Nobrega et al 2015_Revisiting phage terapy PDF Document
Torres-Barceló & Hochberg 2016_Evolutionary Rationale for Phage PDF Document
Milho et al 2019_Antimicrobial assessment of phage terapy… PDF Document
Pires et al 2022_An overview of the current state of phage teraphy… PDF Document
Gorski et al 2020_Phage Therapy… PDF Document
Furfaro et al 2018_Bacteriophage Teraphy… PDF Document
Chang et al 2022_Bacteriophage-Mediated Control of Biofilms… PDF Document
D’Accolti et al 2023_Potential Use of a Combined Bacteriophage-Probiotic Sanitation… PDF Document
Brives & Pourraz 2020_Phage Terapy… PDF Document
Hitchcock et al 2023_Current Clinical Lanscape… PDF Document